南昌双样本-脑胶质瘤组织200基因检测

双样本脑胶质瘤200基因检测采用高通量测序（NGS），覆盖200个基因及MGMT甲基化、7+/10-、1p/19q、TERT、IDH等分子标记，实现WHO 2021分子分型与靶向/化疗用药指导，售价7500元。

适用人群

• 新诊断脑胶质瘤患者，需按WHO 2021标准进行完整分子分型以指导预后评估。
• 高级别胶质瘤（WHO 3-4级）患者，需明确MGMT启动子甲基化状态以判断替莫唑胺获益。
• 复发或进展期胶质瘤患者，需寻找靶向治疗或临床试验入组机会。
• IDH野生型低级别胶质瘤患者，需通过染色体7+/10-和TERT启动子突变等指标排除GBM可能。
• 少突胶质细胞瘤疑似患者，需检测1p/19q联合缺失以确认诊断并指导烷基化药物选择。
• 需综合评估遗传风险（如NF1、Li-Fraumeni综合征）的胶质瘤患者，本检测同步分析胚系突变。

检测内容

本检测基于高通量测序（NGS）技术，对脑胶质瘤手术组织石蜡贴片及血液白细胞进行双样本分析，覆盖200个与肿瘤密切相关的基因，同时整合MGMT启动子甲基化、染色体7+/10-、1p/19q联合缺失、TERT启动子突变、IDH1/IDH2突变、ATRX突变、EGFR扩增等分子标记。NGS技术可同步检出点突变（SNV）、小片段插入缺失（INDEL）、拷贝数变异（CNV）及基因融合（FUSION）四种突变类型，避免传统单一方法（如FISH仅检融合、焦磷酸测序仅检甲基化）的局限。通过组织样本分析体细胞突变（肿瘤特异性变异），血液白细胞作为对照区分胚系突变（遗传风险），并完成微卫星不稳定性（MSI）评估（本例结果为MSS）。能发现：WHO 2021分子分型所需的全部标志（如IDH突变型星形细胞瘤需IDH突变+ATRX失活+1p/19q完整）、靶向用药相关变异（如TSC2、BRCA2）、化疗敏感性标志（MGMT甲基化）、预后分层指标（7+/10-提示GBM预后差）。不能发现：RNA层面的基因表达谱、非编码RNA、全基因组结构变异（如大片段易位）、表观遗传修饰（除MGMT甲基化外）。检出率依赖样本质量：组织样本需肿瘤细胞含量≥20%，本报告显示样品质量合格，检出3个诊断预后相关分子标记及5个体细胞突变。

检测流程

样本类型为手术组织石蜡贴片（已固定包埋的病理标本）配合外周血（白细胞）。无需空腹，无饮食限制。组织样本由医院病理科直接提供石蜡切片或蜡块，血液样本可在当地医院或合作采血点采集（支持南昌本地服务）。对于不便到院患者，提供样本邮寄方案：血样使用专用采血管常温运输（48小时内到达），组织石蜡贴片常温邮寄。全程无需患者自行操作，由临床医生或护士完成采样。报告周期常规为3-4周（本例因多标志物分析耗时约3.5个月为特例）

准确性说明

准确性：NGS技术对SNV/INDEL的检测灵敏度≥99%（覆盖深度≥500×），CNV检测通过双样本对比（组织vs血液）消除个体基线干扰，融合基因检测采用RNA/DNA双策略降低假阴性。安全性：仅需外周血5ml，无创；组织样本为术后标本，无额外创伤。结果意义：阳性结果（如IDH1突变、MGMT甲基化）直接指导WHO分型、预后分层（IDH突变型预后相对良好）及治疗方案（MGMT甲基化者替莫唑胺获益显著）；阴性结果（如本例MGMT未甲基化）提示替莫唑胺获益有限，需考虑临床试验。后续路径：检出靶向变异（如BRCA2剪接突变→PARP抑制剂试验；TSC2移码突变→mTOR抑制剂试验）可推荐入组；MSS结果提示免疫单药效果差；0个致病胚系突变排除遗传综合征。所有结果需结合病理形态学综合判读

详细流程

1. 临床医生评估患者适应症（新诊断或复发胶质瘤），开具检测申请。
2. 在南昌合作医院或采血点采集外周血5ml（EDTA抗凝管），同步从病理科获取手术组织石蜡贴片（5-10张，厚度4-5μm）。
3. 样本常温运输至检测实验室（血样48小时内，组织贴片无时间限制）。
4. 实验室接收后质检：组织样本评估肿瘤细胞含量（需≥20%），血样评估DNA完整性。
5. 双样本并行提取DNA（组织+白细胞），组织样本另提取RNA（用于融合检测）。
6. 构建NGS文库：200基因panel捕获（设计含全外显子+关键内含子区域），MGMT甲基化使用焦磷酸测序或甲基化特异性PCR。
7. 上机测序（Illumina平台，PE150，平均深度≥1000×），生物信息学分析比对到参考基因组，识别SNV/INDEL/CNV/FUSION及甲基化状态。
8. 生成报告：整合分子分型（WHO 2021标准）、用药指导（靶向/化疗/免疫）、遗传风险评估，经遗传咨询师审核后发送给临床医生（电子版+纸质版），周期约3-4周。

• 组织样本需为手术切除或活检标本，穿刺样本需确认肿瘤细胞含量是否达标。
• 血液样本需同步采集，不可单独使用组织样本完成胚系突变分析。
• 检测前无需空腹或停药，但需告知医生近期化疗/放疗史（可能影响突变检出）。
• MGMT甲基化阴性不等于替莫唑胺完全无效，仍可考虑Stupp方案标准治疗。
• 结果中胚系突变（如BRCA2、TSC2）为致病性时，建议遗传咨询及家族成员筛查。
• 本检测为综合分子诊断，不能替代组织病理学诊断，需结合HE染色及免疫组化。
• 报告周期可能因样本质量或标志物分析复杂性延长（如本例历时3.5个月），常规为3-4周。
• 检测后如出现新发症状或影像学进展，可能需重复检测（如复发后新突变评估）。